08. Молекулярно-генетична діагностика картопляних цистоутворювальних нематод, поширених у зонах Полісся, Лісостепу та в Українських Карпатах

Пилипенко Л. А., Карелов А. В., Козуб Н. О., Созінов І. О., Ваврух О. Р., Зеля Г. В., Зеля А. Г.
Сторінки: 36-39.

Повна стаття: 
Короткий огляд
Мета. Визначити видовий склад карантинних організмів — картопляних цистоутворювальних нематод, поширених у зонах Полісся, Лісостепу та в Українських Карпатах. Методи. Польовий (маршрутні обстеження), лабораторні (екстракція нематод з грунтових проб; ідентифікація нематод за використання мультиплексної полімеразно-ланцюгової реакції зі специфічними праймерами, комплементарними рибосомному гену 18S та внутрішньому транскрибованому спейсеру ІTS1). Результати. За використання мультиплексної полімеразно-ланцюгової реакції зі специфічними праймерами встановлено поширення Globodera rostochiensis у межах Тернопільської (загальна площа заражених угідь — 375,02 га), Закарпатської (16,75 га) Чернівецької (0,61 га) областей України. Розташування карантинних вогнищ у переважній більшості припадає на присадибні ділянки населення. Висновки. Засвідчено доцільність подальшої валідації методу за використання ширшої панелі зразків цистоутворювальних нематод із різних регіонів України. Одержані результати покладено в основу рекомендацій щодо здійснення фітосанітарного контролю в межах заражених територій для ефективної локалізації та ліквідації виявлених карантинних вогнищ.

Ключові слова: картопляні цистоутворювальні нематоди, молекулярна діагностика, мультиплексна полімеразно-ланцюгова реакція, поширення нематод.

Бібліографія
  1. Anthoine G. Variability of the ITS rDNA and identification of Nacobbus aberrans (Thorne, 1935) Thorne&Allen, 1944 (Nematoda: Pratylenchidae) by rDNA amplification/G. Anthoine, D. Mugniery//Nematology. — 2005. — V. 7. — Р. 503 – 516.
  2. Biochemical and molecular characterization of plant-parasitic nematodes/I. Abrantes, M. Santos, L.I. Conceicao еt al.//Phytopathol. Mediterr. — 2004. — V. 43. — № 2. — Р. 232 – 258.
  3. Blok V.C. Molecular diagnostics for plant — parasitic nematodes/ V.C. Blok//Nematology Monographs and Persectives. — 2003. — V. 2. — P. 1 – 12.
  4. Bulman S.R. Differentiation of Australasian potato cyst nematode (PCN) populations using the polymerase chain reaction (PCR)/S.R. Bulman, J.W. Marshall//New Zealand Journal of Crop and Horticultural Science. — 1997. — V 25. — P. 123 – 129.
  5. Castagnone C. Satellite DNA-based species specific identification of single individuals of the pinewood nematode Bursaphelenchus xylophilus (Nematoda: Aphelenchoididae)/C. Castagnone, P. Abad, P. Castagnone-Sereno//European J. of Plant Pathology. — 2005. — V. 112. — Р. 191 – 193.
  6. Fenwick D.W. Methods for the recovery and counting of cysts of Heterodera schachtii from soil/D.W. Fenwick//J.l of Helminthology. — 1940. — V. 18. — P. 155 – 172.
  7. Ferris V. Variation in spacer ribosomal DNA in some cyst-forming species of plant parasitic nematodes/V. Ferris, J.M. Ferris, J. Faghihi//Fundamental and Applied Nematology. — 1993. — V. 16(2). — P. 177 – 184.
  8. Identification of Ditylenchus species associated with Fabaceae seeds based on a specific polymerasechain reaction of ribosomal DNA – ITS regions/M. Kerkoud, M. Esquibet, O. Plantard et al.//European J. of Plant Pathology. — 2007. — V. 118. — Р. 323 – 332.
  9. Identification of Globodera rostochiensis and G. pallida in the Ukraine by PCR/L.A. Pylypenko, T. Uehara, M.S. Phillips еt al.//European J. of Plant Pathology. — 2005. — V. 111. — Р. 39 – 46.
  10. ITS – RFLP analysis, an efficient tool for identification of Bursaphelenchus species/W. Burgermeister, H. Braasch, K. Metge еt al.//Nematology. — 2009. — V. 11(5). — Р. 649 – 668. 11. Molecular characterisation of Chinese Heteroderaglycines and H. аvenae populations based on RFLPs and sequences of rDNA – ITS regions/J. Zheng, S.A. Subbotin, L. Waeyenberge, M. Moens//Russian Journal of Nematology. — 2000. — V. 8. — Р. 109 – 113.
  11. Molecular diagnosis, taxonomy, and phylogeny of the stem nematode Ditylenchus dipsaci species complex based on the sequences of the internal transcribed spacer-rDNA/S.A. Subbotin, M. Madani, E. Krall еt al.//Phytopathology. — 2005. — V. 95. — Р. 1308 – 1315.
  12. Oliveira C.M.G. Morphological and molecular diagnostics for plant-parasitic nematodes: working together to get the identification done/C.M.G. Oliveira, A.R. Monteiro, V. Blok//Tropical Plant Pathology. — 2011. — V. 36(2). — P. 65 – 73.
  13. Wishart J. Ribosomal intergenic spacer: a polymerase chain reaction diagnostic for Meloidogyne chitwoodi, M. fallax and M. hapla/J. Wishart, M.S. Phillips, V.C. Blok//Phytopathology. — 2002. — V. 92. — Р. 884 – 892.