05. Розробка молекулярно-біологічної системи для ідентифікації рнк-4 українського ізоляту вірусу некротичного пожовтіння жилок буряку
Гринчук К. В., Антіпов І. О.
Сторінки: 24-26.
Повна стаття:
Ключові слова: вірус некротичного пожовтіння жилок буряку, протеїн, РНК.
Сторінки: 24-26.
Повна стаття:
Короткий огляд
Мета. Розробити систему ідентифікації РНК-4 українського ізоляту вірусу некротичного пожовтіння жилок буряку (ВНПЖБ) на основі полімеразної ланцюгової реакції. Методи. Молекулярно-біологічні. Результати. Проведено біоінформативний аналіз нуклеотидних послідовностей РНК-4 ізолятів ВНПЖБ. Установлено консервативні послідовності гена, що кодує протеїн Р31 ВНПЖБ, та розроблено дизайн праймерів для ідентифікації РНК-4. Оптимізовано ПЛР-систему ідентифікації РНК-4 за температурними показниками відпалу праймерів. Висновки. Розроблена система діагностики дає змогу своєчасно ідентифікувати ВНПЖБ для запобігання його розповсюдженню.Ключові слова: вірус некротичного пожовтіння жилок буряку, протеїн, РНК.
Бібліографія
- Савчук О. Ризомания — опасная вирусная болезнь сахарной свеклы [Електр. ресурс]/О. Савчук//Зерно — 2007. — № 1. — Режим доступу до ресурсу: http://pesticidov.net/ru/articles/pesticidi/4405/.
- Identification, subcellular localization and some properties of a cysteine-rich suppressor of gene silencing encoded by peanut clump virus/P. Dunoyer, S. Pfeffer, C. Fritsch et al.//Plant Journal. — 2002. — № 29. — P. 555–567.
- Multiple sequence alignment by Florence Corpet [Електр. ресурс]. — Режим доступу до ресурсу: http://multalin.toulouse.inra.fr/multalin/.
- National Center for Biotechnology Information [Електр. ресурс]. — Режим доступу до ресурсу: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed.
- Pavli O.I. Molecular characterization of beef necrotic yellow vein virus in Greece and transgenic approaches towards enhancing rhizomania disease resistance: dissert. of doctor of agricultural sciences/O.I. Pavli. — Wageningen, 2010. — P. 166.
- Pferdmenges F. Occurrence, spread and pathogenicity of different Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) isolates: dissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Fäkultät für Agrarwissenschaften/F.Pferdmenges — Göttingen, 2007. — S. 111.
- Plant Viruses Online. Beet necrotic yellow vein furovirus. [Електр. ресурс]/А. Brunt, K. Grabtree, K. Dalwitz et al. — 1996. — Режим доступу до ресурсу: http://pvo.bio-mirror.cn/descr086.htm.
- Primer3web version 4.0.0 — Pick primers from a DNA sequence. [Електр. ресурс] — Режим доступу до ресурсу: http://primer3.ut.ee/.
- Production and Pathogenicity of Isolates of Beet Necrotic Yellow Vein Virus with Different Numbers of RNA Components/T. Tamada, Y. Shirako, H. Abe et al.//Journal of General Virology. — 1989. — № 70. — Р. 3399–3409.
- RNA4-encoded p31 of beet necrotic yellow vein virus is involved in efficient vector transmission, symptom severity and silencing suppression in roots/M.D. Rahim, I.B. Andika, Ch. Han et al.//Journal of General Virology. — 2007. — № 88. — Р. 1611–1619.
- Virus Taxonomy: the Classification and Nomenclature of Viruses/C.M. Fauquet, M.A. Mayo, J. Maniloff et al. — San Diego, CA. USA: Elsevier Academic Press, 2005. — Р. 1162.